Tre avdelningar
Boverket består av en verksamhetsavdelning, en uppdragsavdelning och en avdelning för verksamhetsstöd.
Verksamhetsavdelningen

Avdelningschef Peter Fransson ansvarar för verksamhetsavdelningen. Avdelningen ansvarar framför allt för uppdrag och projekt som rör styrmedel och fastighetsekonomi, tekniska egenskaper, energi och samhällsekonomi samt hållbara byggnader och byggprodukter. Avdelningen ansvarar också för uppdrag och projekt som rör hållbara städer, boende och stadsutveckling, plan- och byggfrågor samt strategisk planering.
Uppdragsavdelningen

Avdelningschef Richard Bauer ansvarar för uppdragsavdelningen. Avdelningen ansvarar för Boverkets större uppdrag.
Avdelningen för verksamhetsstöd

Avdelningschef Irene Nyman ansvarar för avdelningen för verksamhetsstöd som arbetar med myndighetens administration, ekonomi, IT-frågor, personalfrågor samt information och kommunikation.